Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Csnka2ipQ8CH19 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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