Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pcsk9Q80W65 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pcsk9Q80W65 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pcsk9Q80W65 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pcsk9Q80W65 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pcsk9Q80W65 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pcsk9Q80W65 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Pcsk9Q80W65 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pcsk9Q80W65 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms