Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ccdc88cQ6VGS5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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