Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pkp4Q68FH0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pkp4Q68FH0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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