Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Adra1a-203ENSMUST00000159365 4118 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fcamr-201ENSMUST00000027670 1743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Herc3-202ENSMUST00000041401 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Trappc1Q5NCF2 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms