Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn34b4Q3V0X2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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