Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms