Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Skap2Q3UND0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms