Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem253Q3UNB8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem253Q3UNB8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms