Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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Q3U6N9 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Q3U6N9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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