Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kdm4dQ3U2K5 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 348.9 ms