Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc39dQ0VF76 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc39dQ0VF76 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc39dQ0VF76 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ttc39dQ0VF76 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc39dQ0VF76 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Ttc39dQ0VF76 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Ttc39dQ0VF76 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ttc39dQ0VF76 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms