Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rundc1Q0VDN7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rundc1Q0VDN7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms