Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm26750-201ENSMUST00000181718 711 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 D730045A05Rik-201ENSMUST00000159260 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Gm43362-201ENSMUST00000198192 2470 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
TrioQ0KL02 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Mettl7b-201ENSMUST00000026398 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TrioQ0KL02 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms