Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Cdx4Q07424 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms