Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl7Q03366 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl7Q03366 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms