Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Mc1rQ01727 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms