Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms