Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fgd1P52734 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fgd1P52734 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms