Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
FmodP50608 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
FmodP50608 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
FmodP50608 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms