Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Tmod1P49813 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Tmod1P49813 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms