Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Epb41P48193 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms