Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ighv1-22-201ENSMUST00000103507 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ccl6-201ENSMUST00000019071 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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PtprmP28828 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PtprmP28828 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm15661-201ENSMUST00000117390 556 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PtprmP28828 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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