Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nfkb1P25799 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms