Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P20040 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P20040 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P20040 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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