Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Irf1P15314 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Irf1P15314 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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