Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Wdr62-201ENSMUST00000108190 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms