Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CopeO89079 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
CopeO89079 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
CopeO89079 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CopeO89079 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CopeO89079 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms