Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20939L7N243 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms