Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms