Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms