Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 H2-Eb2-201ENSMUST00000050325 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 BB014433-203ENSMUST00000179941 1543 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Armcx5-201ENSMUST00000096321 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm9866-207ENSMUST00000222954 1057 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Lrtm1-202ENSMUST00000224708 1646 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gng7-202ENSMUST00000099462 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Cd22-203ENSMUST00000186154 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Gm1559-201ENSMUST00000219596 3117 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Gm20538F6Z9R1 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms