Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm3543D3Z235 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3543D3Z235 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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