Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Clrn2B2RVW2 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Clrn2B2RVW2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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