Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rrn3B2RS91 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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