Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Prdm16A2A935 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Prdm16A2A935 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Prdm16A2A935 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Prdm16A2A935 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Prdm16A2A935 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Prdm16A2A935 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm16A2A935 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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