Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm3550W4VSN7 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Gm3550W4VSN7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms