Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms