Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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