Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Usp12Q9D9M2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Usp12Q9D9M2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms