Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Phf6Q9D4J7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms