Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2e1Q9D0D5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms