Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Atp6v0e1Q9CQD8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms