Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp1b4Q99ME6 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp1b4Q99ME6 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms