Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cenpn-201ENSMUST00000034205 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm13543-201ENSMUST00000121230 796 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm29272-201ENSMUST00000185476 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21919-201ENSMUST00000185653 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm28446-201ENSMUST00000186508 694 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm28680-201ENSMUST00000186743 480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21824-201ENSMUST00000186810 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21862-201ENSMUST00000186957 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21796-201ENSMUST00000187116 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21795-201ENSMUST00000187263 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm28814-201ENSMUST00000187334 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21720-201ENSMUST00000187428 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm20827-201ENSMUST00000187928 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21766-201ENSMUST00000187962 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21837-201ENSMUST00000188117 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21829-201ENSMUST00000188787 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21892-201ENSMUST00000189182 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21777-201ENSMUST00000189307 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm28247-201ENSMUST00000189329 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gm20793-201ENSMUST00000190779 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm28879-201ENSMUST00000190973 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21752-201ENSMUST00000191023 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm28841-201ENSMUST00000191284 695 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gm21878-201ENSMUST00000191365 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21855-201ENSMUST00000191596 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm20833-201ENSMUST00000192708 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21907-201ENSMUST00000192989 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gm20851-201ENSMUST00000193038 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm37476-201ENSMUST00000193046 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21678-201ENSMUST00000193567 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21768-201ENSMUST00000194103 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm20836-201ENSMUST00000194582 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Gm21660-201ENSMUST00000195789 696 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PtprtQ99M80 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Cd247-202ENSMUST00000027849 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprtQ99M80 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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