Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Rab28Q99KL7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rab28Q99KL7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Rab28Q99KL7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rab28Q99KL7 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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