Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Apobec3Q99J72 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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