Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ttc39cQ8VE09 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ttc39cQ8VE09 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms