Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ssh3Q8K330 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms