Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SrrdQ8K2M3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms